Unit Kerja Pada BPTUHPT Siborongborong terdiri atas:

Sub Bagian Tata Usaha

Pelayanan Teknis (Instalasi Ternak Kerbau Perah Silangit, Instalasi Ternak Kerbau Bahal Batu, Instalasi Ternak Babi Bahal Batu, Instalasi Ternak Kerbau Rondaman Palas)

Prasarana dan Sarana Teknis

Informasi dan Jasa Produksi